Las divisiones inferiores de Independiente están categorizadas por edad, dividiéndose en: Cuarta, Quinta, Sexta, Séptima, Octava y Novena División. En negrita las competiciones vigentes en la actualidad. Con consagraciones en los años 1973, 1974 y 1976; 1994 y 1995; 2010 y 2017, camiseta atletico de madrid 2022 respectivamente. Después de una exitosa campaña, hubo mucha especulación sobre la transferencia de Santa Cruz en el inicio de la Premier League 2008-09. Sin embargo, firmó un contrato de cuatro años con el Blackburn en agosto para poner fin a la especulación.
